Dưới đây là một số nhận thức, quan niệm sai lầm thường gặp trong xã hội về Người chuyển giới:[22]

Người chuyển giới là một giới tính sinh học khác biệt:

Đây là quan điểm sai. Thực chất người chuyển giới được sinh ra với một cơ thể có giới tính sinh học bình thường, hoàn chỉnh (phân biệt rõ là nam hay nữ), vấn đề là họ có cảm nhận và mong muốn giới tính của mình không trùng với giới tính sinh học đang có. Đây là một vấn đề về mặt tâm lý, không phải về thể chất sinh lý.

Ngoài ra, cũng cần phân biệt Người chuyển giới với những người sinh ra có dấu hiệu giới tính không rõ ràng, không hoàn chỉnh gọi là người liên giới tính - tên tiếng Anh: intersex (ví dụ, một đứa trẻ sinh ra tồn tại cả dấu hiệu của giới tính nam như vừa có dương vật, tinh hoàn lại vừa có cả dấu hiệu của giới tính nữ như buồng trứng, dạ con, ngực lớn giống nữ giới...; hoặc những người có cơ quan sinh dục không rõ nam hay nữ...). Về bản chất, giới tính của những người liên giới tính chưa rõ ràng, và không phù hợp với định nghĩa điển hình của nam giới hay nữ giới. Điều này hoàn toàn khác so với Người chuyển giới là đã có định hình giới tính hoàn chỉnh khi sinh ra.

Người chuyển giới thì luôn muốn phẫu thuật chuyển giới:

Người chuyển giới và chuyển đổi giới tính là hai khái niệm không trùng khớp nhau, đôi khi bị nhầm lẫn. Người chuyển giới chỉ nói về cảm nhận giới, không phụ thuộc việc người đó đã chuyển giới hay chưa. Trong trường hợp người chuyển giới đã thực hiện phẫu thuật theo giới tính mình mong muốn thì đây là người chuyển giới đã thực hiện phẫu thuật, và không phải người chuyển giới nào cũng muốn phẫu thuật chuyển giới vì nhiều nguyên nhân khác nhau (do không có điều kiện tài chính, không muốn mất khả năng sinh dục, không muốn bị tác động xấu đến sức khỏe...)[23].

Người chuyển giới và Người đồng tính luyến ái là một:

Thực chất, Người chuyển giới và Người đồng tính luyến ái cũng hai khái niệm hoàn toàn khác nhau. Đồng tính luyến ái đề cập tới xu hướng tính dục của con người (5 xu hướng chính: hấp dẫn người cùng giới/giới tính - đồng tính luyến ái, hấp dẫn với người khác giới/giới tính - dị tính luyến ái, hấp dẫn với hai giới/giới tính - song tính luyến ái, hấp dẫn với tất cả giới và giới tính - toàn tính luyến ái, không hấp dẫn với giới hay giới tính nào - vô tính luyến ái). Trong khi đó người chuyển giới nói về bản dạng giới, từ đó phân chia thành: Người hợp giới (bản dạng giới trùng với giới tính lúc mới sinh), Người chuyển giới (bản dạng giới khác với giới tính lúc mới sinh) và Linh hoạt giới (bản dạng giới thay đổi theo thời gian, tại một thời điểm nhất định, một người có thể là người hợp giới, và tại một thời điểm khác, người đó có thể là người chuyển giới). Một người nam nhận dạng bản thân là nữ, ăn mặc, trang điểm, cử chỉ yểu điệu mọi người thường cho là đồng tính, nhưng thực tế đó là Người chuyển giới (giới tính sinh học là nam, bản dạng giới là nữ). Trong khi đó, một người đồng tính nam hoàn toàn có thể có ngoại hình rất nam tính, và người đó hài lòng với giới tính bẩm sinh là nam của mình. Tuy nhiên, cũng có những người có sở thích khác với giới của họ, ví dụ như một người có giới tính là nữ, nhận thức bản thân cũng là nữ nhưng thích ăn mặc và tập võ giống một người nam, những người như vậy không phải là người chuyển giới, bởi về bản chất họ vẫn nhận dạng bản thân có giới tính khớp với giới tính sinh học của mình, chỉ có thể hiện giới của họ là khác, có thể là do sở thích hoặc công việc của họ mà thôi.

Trong xã hội, nhiều người nhìn những trường hợp nam giới cải trang ngoại hình thành nữ giới hay ngược lại, nữ giới cải trang thành nam giới thì nhận định họ là người đồng tính luyến ái, đó là quan điểm chưa chính xác. Trừ một số người cải trang thành người giới tính khác do mục đích công việc thì đa số những người này đều là Người chuyển giới. Do mong muốn thành người có giới tính ngược lại nên họ đã cải trang như vậy, họ chỉ cải trang mà không phẫu thuật chuyển giới vì pháp luật chưa cho phép, chưa có điều kiện kinh tế hoặc do lo ngại những tác động xấu đến sức khỏe của bản thân[16].

Người chuyển giới cũng có thể thuộc một trong 5 xu hướng tính dục chính: đồng tính, dị tính, song tính, toàn tính hay vô tính. Nhu cầu của Người đồng tính là yêu đương người cùng giới tính. Còn nhu cầu của Người chuyển giới là chuyển đổi cơ thể sang giới tính mà mình cảm nhận, khác với giới tính bẩm sinh của cơ thể họ[23].